Selvom Bourgogne fremstiller nogle af verdens bedste vine, kan opdeling og klassifikation af vine blive lidt kringlet. Dog i korte træk har kirken ejet de bedste skovområder og vinmarker frem til den franske revolution. Herefter begyndte man at give jorden til bønder og købmænd. Hele Bourgognes klassifikation blev formaliseret i 1930’erne, som også i dag kategoriserer vine i fire niveauer.
Regionale vine – disse er de generelle vine, som er simplere og fremstilles af Chardonnay eller Pinot Noir druesorter, for eksempel Bourgogne AOC.
Landsby vine – i disse vine skal alle druesorter som anvendes i fremstilling af vinen fra den pågældende landsby fremstå på vinens stikket. I Bourgogne befinder der sig i alt 44 landsbyer, hvor nogle af de berømte er Gevrey-Chambertin, Volnay, Puligny-Montrachet og Meursault.
Premier Cru og Grand Cru – vingårde som fremstiller disse vine er udvalgte vinproducenter, som over historisk lang periode har vist overlegne evner at fremstille vin. Der findes 629 Premier Cru-vinmarker og 33 Grand Cru-vinmarker. Samtlige druesorter, som anvendes i denne kategori, skal stamme fra den angivne vingård.